Mae'r symptomau'n ymddangos rhwng 10 a 15 diwrnod ar ôl brathiad y pryfyn heintiedig. Rhai mathau o barasit malaria (Plasmodium vivax et Plasmodium hirgrwn) gall aros yn anactif yn yr afu am wythnosau neu hyd yn oed fisoedd cyn i'r arwyddion cyntaf ymddangos.

Nodweddir malaria gan ymosodiadau rheolaidd sy'n cynnwys tri cham:

• Oerni;
• Cur pen;
• Blinder a phoen cyhyrau;
• Cyfog a chwydu;
• Dolur rhydd (yn achlysurol).

Awr neu ddwy awr yn ddiweddarach:

• Twymynau uchel;
• Mae'r croen yn dod yn boeth ac yn sych.

Yna mae tymheredd y corff yn gostwng:

• Chwys chwys;
• Blinder a gwendid;
• Mae'r person yr effeithir arno yn cwympo i gysgu.

Gall heintiau P. vivax a P. ovale malaria ailwaelu ychydig wythnosau neu hyd yn oed fisoedd ar ôl yr haint cyntaf hyd yn oed os yw'r claf wedi gadael ardal yr haint. Mae'r penodau newydd hyn oherwydd ffurfiau hepatig “segur”.